O Guarani foi fundando em 15 de fevereiro de 1928. Até o ano de 1999 participava apenas de competições não profissionais, conquistando neste período sete títulos do Campeonato Municipal de Palhoça (1978, 1985, 1986, 1994, 1995, 1998 e 1999). A partir do ano 2000 o “Bugre Palhocense” começou a disputar competições profissionais da Federação Catarinense de Futebol.
Em 2003 o Guarani conquistou seu primeiro título na era profissional, a Segunda Divisão do Campeonato Catarinense. No ano seguinte disputou pela primeira vez a Primeira Divisão Estadual, terminando na 4ª colocação. Disputou a Primeira Divisão entre 2004 a 2008, retornando em 2013 após voltar a ser campeão da “Segundona” em 2012. Voltou a disputar a Segunda Divisão em 2014 e novamente conquistou o acesso, sendo vice-campeão. No mesmo ano disputou sua primeira competição nacional, a Série D do Campeonato Brasileiro, após conquistar a vaga pela Copa Santa Catarina de 2013, onde terminou em 3º lugar.
Em 2015, após um campeonato muito disputado, a equipe não conseguiu se manter na primeira divisão do catarinense por muito pouco. Nessa edição o atacante Vitinho se destacou como artilheiro da competição com 11 gols, e a equipe levou o prêmio de fair play por ser a mais disciplinada, tendo nenhuma expulsão durante o campeonato. Neste mesmo ano, o Guarani concretizou a parceria com o projeto Bom de Bola Esporte Clube, reforçando as categorias de base da equipe.
Com a desistência do Atlético de Ibirama da serie A do Catarinense em 2016, o Guarani fica com a vaga e permanece na elite do estado.
Fonte/Arte: Ascom/Guarani de Palhoça
